Основными задачами являются:
соблюдение режима секретности в УФСИН России по Республике Башкортостан и подведомственных учреждениях;
обеспечение передачи информации, содержащих сведения, составляющих государственную тайну;
контроль выполнения мероприятий при обработке информации ограниченного распространения на средствах вычислительной техники.
Учитывая значительную роль подразделений по защите государственной тайны УИС, в целях повышения престижа службы, формирования исторической преемственности среди работников подразделений по защите государственной тайны УИС РФ на основании приказа ФСИН России от 27.01.2020 №22, 14 февраля объявлено Днем работника подразделений по защите государственной тайны УИС РФ